BasePedia开源工具

由Basepedia开发和维护的代码，将逐步实现开源化，测试版本均公布在此处，可发邮件到 tech@basepedia.com 索要测试版的源代码。稳定后的版本会公布在Github/Basepedia。

发信格式示例：

申请人张三
单位XX大学，XX学院，XX重点实验室
职称学生or博士研究生or教授or副教授 …
申请代码包XXXXXX
申请用途麻烦描述清楚，有助于审核通过

目前公布的开源工具列表：（点击可查看使用方法）

  1. GeneStruct - 用于解析基因结构，基因与转录本间的关系，格式化基因和转录本信息，有效解析UTR，intron等区域。
  2. PSR Modify version - 用于鉴定全基因组范围SSR位点的多态性，并进行样本SSR分型。
  3. Insertsite - 用于识别宿主基因组上，其他物种基因组（如病毒，真菌or转基因片段）的插入位点pipeline，能够精确定位到整合的位点（误差范围1bp）
  4. Simpbs - 自主开发的集群调度系统，目前处于试运行版
  5. CINcalc - 用于估计肿瘤基因组不稳定性