MISA SSR结果扩展格式说明
用于记录SSR标记的群体分型信息
Fields 说明
1. 示例:
Chrom SSR_No. SSRtype SSRunit_reference SSRsize_reference SSR_start_reference SSR_end_reference RO141.genotype RO141.genotype_support_reads E2328_L144 1 p2 (GC)7 14 32 45 7;5 10;9
2. 格式说明
- 前七列与misa ssr格式输出一致
- 第八列,genotype,样本基因型,示例中为RO141编号的样本的基因型,分别为(GC)7 和 (GC)5
- 第九列,genotype support reads,样本基因型支持的reads数目,(GC)7的reads支持数目为7,(GC)5的reads支持数目为5,可见为杂合基因型。
Contributors: rongzhengqin@basepedia.com